Poważnym problemem dla mieszkańców świata Anno są katastrofy. Przychodzą nagle i niszczą wszystko co napotkają na swojej drodze. Mają znaczny wpływ na życie i zadowolenie mieszkańców twojej wyspy.

Trzęsienia ziemi

Mają one niszczycielską moc. Powodują pożary i zapadanie się domów, Powstają wielkie szczeliny w ziemi blisko epicentrum trzęsienia. Zaczyna się panika. Wszyscy uciekają ze swoich domów. Po pewnym czasie trzęsienie ustaje i rozpoczyna się odbudowa domów i sprzątanie szkód.

Pożary

Ogień uszkadza wiele budynków w mieście. Jego siła jest ogromna. Przeskakuje z domu na dom rozprzestrzeniając się. W celu wygaszenia ognia konieczne jest postawienia budynku Straży pożarnej. Po zagaszeniu ognia rozpoczyna się liczenie strat.

Plagi

Gdy twoi mieszkańcy dojdą na poziom Obywatela, będzie wtedy ryzyko plagi. Budynki wtedy są otoczone zieloną mgiełką. Drastycznie zredukuje się populacja, a budynki mieszkańcy zaczną się cofać na poprzedni poziom cywilizacyjny. Po pewnym czasie plagi ustają i rozpoczyna się kwarantanna. Po pewnym czasie ustaje i mieszkańcy kontynuują codzienne zajęcia.

Erupcje wulkanów

Na niektórych wyspach znajdują się wulkany. Jak to w ich naturze bywa, czasami wybuchają powodując duże straty. Bardzo rzadko się spotyka wulkany na wyspach w świecie Anno. Przed wybuchem wydostaje się z jego szczytu czarny dym. Podczas wybuchu z wulkanu wylewa się lawa. Rozrzucane są na wszystkie strony palące się skały, które powodują pożary. Ludzie wpadają w histerię. Wszyscy uciekają w panice.

Tornada

Tornado przedziera się przez ląd. Nie zważa na nic co znajduje się na jego drodze. Niszczy budynki, mury obronne. Wywołuje wśród ludzi panikę. Gdy tornado przedziera się przez morze, nie powinno się pływać statkami na drodze którą przemierza.